تعتبر مدينة كوتاباتو مركزاً إسلامياً رئيسياً في مينداناو، وهي موطن مسجد السلطان الحاج حسن البلقية الجميل، أحد أكبر المساجد في الفلبين. تمتلك المدينة جذوراً إسلامية عميقة تمتد لقرون وتُعتبر العاصمة الإسلامية لجنوب الفلبين، مع غالبية مسلمة من شعوب الماغيندانو وشعوب مورو الأخرى. يتجلى التراث الإسلامي الغني للمدينة في عمارتها التقليدية ومؤسساتها التعليمية الإسلامية والممارسات الثقافية الإسلامية النابضة بالحياة التي حُفظت لأجيال.