Fergana memiliki beberapa masjid bersejarah termasuk Masjid Said Ahmad Khoja yang indah, menampilkan elemen arsitektur Islam tradisional Lembah Fergana. Kota ini telah menjadi pusat Islam penting selama berabad-abad, berfungsi sebagai pusat keilmuan Islam dan perdagangan di sepanjang Jalur Sutra. Komunitas Muslim lokal terus mempraktikkan adat Islam tradisional dan mempertahankan koneksi kuat dengan warisan Islam yang kaya melalui festival keagamaan dan tradisi budaya.