Baalbek menempatkan beberapa masjid bersejarah termasuk Masjid Ras al-Ain dari era Mamluk yang mempamerkan elemen seni bina Islam klasik. Bandar ini telah menjadi rumah kepada komuniti Muslim sejak penaklukan Islam awal, dengan kedudukannya di sepanjang laluan perdagangan purba menjadikannya penting untuk ilmu dan budaya Islam. Komuniti Muslim yang cergas hari ini mengekalkan tradisi berabad-abad sambil memelihara warisan Islam yang kaya di bandar ini bersama dengan runtuhan Rom yang terkenal.