Lagos menempatkan beberapa masjid bersejarah termasuk Masjid Pusat Pulau Lagos dan Masjid Shitta-Bey, yang mempamerkan seni bina Islam yang indah dengan menara yang tersendiri dan dewan solat. Bandar ini berkhidmat sebagai pusat utama bagi komuniti Muslim Nigeria, dengan institusi pendidikan Islam dan amalan keagamaan yang cergas. Penduduk Muslim Lagos yang pelbagai menyumbang secara signifikan kepada fabrik budaya bandar melalui perayaan Islam, pasar-pasar, dan pertubuhan masyarakat.